Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Lrfn4Q80XU8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms