Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Zbed4Q80WQ9 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Zbed4Q80WQ9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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