Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Trpv2-201ENSMUST00000018651 2909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm11868-201ENSMUST00000121594 1478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
ClmQ7TSN2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms