Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Dsg1cQ7TSF0 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Dsg1cQ7TSF0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms