Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Actn1Q7TPR4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms