Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed3Q78IS1 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Tmed3Q78IS1 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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