Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Ccdc88cQ6VGS5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc88cQ6VGS5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Ccdc88cQ6VGS5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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