Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Krt40Q6IFX3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Krt40Q6IFX3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms