Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

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Length 1,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc3c1Q6DFV6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Fndc3c1Q6DFV6 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc3c1Q6DFV6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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