Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Trim28Q62318 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim28Q62318 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Trim28Q62318 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim28Q62318 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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