Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pde3bQ61409 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms