Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tbc1d1Q60949 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tbc1d1Q60949 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms