Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csnk2a1Q60737 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Csnk2a1Q60737 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Csnk2a1Q60737 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Csnk2a1Q60737 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Csnk2a1Q60737 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csnk2a1Q60737 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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