Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sin3aQ60520 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms