Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Rbm27Q5SFM8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbm27Q5SFM8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rbm27Q5SFM8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rbm27Q5SFM8 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Rbm27Q5SFM8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rbm27Q5SFM8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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