Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trappc3lQ4KL14 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms