Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
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Gm27235Q3UW50 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Gm27235Q3UW50 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Gm27235Q3UW50 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms