Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chpf2Q3UU43 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms