Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Shisa3Q3UPR0 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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