Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Snx27Q3UHD6 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Snx27Q3UHD6 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms