Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ssbp4Q3U4B1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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