Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc9Q3U0M1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc9Q3U0M1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms