Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Fam178bQ24JP3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms