Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp2b3Q0VF55 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Atp2b3Q0VF55 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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