Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrriq1Q0P5X1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrriq1Q0P5X1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrriq1Q0P5X1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrriq1Q0P5X1 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrriq1Q0P5X1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lrriq1Q0P5X1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Lrriq1Q0P5X1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lrriq1Q0P5X1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms