Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vps8Q0P5W1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.3 ms