Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cab39Q06138 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms