Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ccl7Q03366 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms