Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gjb4Q02738 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb4Q02738 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms