Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Mc1rQ01727 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms