Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gjb2Q00977 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.4 ms