Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rbp4Q00724 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms