Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcc1P97496 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Smarcc1P97496 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms