Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Cmklr1P97468 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cmklr1P97468 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cmklr1P97468 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cmklr1P97468 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cmklr1P97468 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cmklr1P97468 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cmklr1P97468 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Cmklr1P97468 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cmklr1P97468 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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