Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Arf1P84078 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Arf1P84078 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms