Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Irx1P81068 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Irx1P81068 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Irx1P81068 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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