Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PtpreP49446 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PtpreP49446 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms