Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
VdrP48281 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
VdrP48281 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
VdrP48281 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
VdrP48281 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
VdrP48281 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms