Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Cdkn1bP46414 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms