Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NodalP43021 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NodalP43021 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NodalP43021 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms