Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mmp9P41245 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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