Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TfamP40630 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TfamP40630 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TfamP40630 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TfamP40630 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TfamP40630 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TfamP40630 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TfamP40630 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TfamP40630 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms