Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Usp4P35123 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Usp4P35123 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Usp4P35123 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Usp4P35123 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Usp4P35123 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp4P35123 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms