Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Apoc1P34928 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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