Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nedd1P33215 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nedd1P33215 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nedd1P33215 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nedd1P33215 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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