Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
VtnP29788 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
VtnP29788 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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