Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd10P28359 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Hoxd10P28359 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd10P28359 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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