Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntf3P20181 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms