Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnnc1P19123 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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