Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18525 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18525 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18525 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18525 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P18525 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18525 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18525 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18525 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P18525 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18525 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18525 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms